Berdirinya MA NU Raden Umar Sa’id Colo dilatar belakangi adanya keinginan dari tokoh masyarakat sekaligus tokoh agama yakni beliau KH. Abdul Haris yang kebetulan pada saat itu masih menjabat sebagai kepala desa Colo Dawe Kudus periode (1998-2007) agar di desa colo wujud lembaga pendidikan tingkat menengah atas agar memberikan kesempatan kepada putra putri terbaik daerah yang telah banyak menyelesaikan program studinya, baik yang dari pendidikan non formal (Mutakhorrijin Pondok Pesantren) maupun pendidikan formal (Alumnus Perguruan Tinggi) untuk mengembangkan keilmuwannya di dunia pendidikan. Selain itu juga memberikan kesempatan terhadap anak usia sekolah di desa Colo dan sekitarnya yang baru bisa mengenyam pendidikan menengah pertama untuk bisa melanjutkan di tingkat menengah atas.
Adanya Himmah dan harapan yang kuat dari KH. Abdul Haris, maka pada Tahun 2004 dikumpulkanlah tokoh agama. Tokoh masyarakat dan para akademisi di balai desa Colo diantaranya KH. Muhtadi A.Ma, K.Hasyim, K.Salman Dll. untuk membahas hal tersebut, keinginan itu ditanggapi secara positif oleh para peserta yang hadir dengan kesepakatan mendirikan sekolah yang diberi nama MA NU Raden Umar Sa’id (nama tersebut diambil dari salah satu wali 9 yang kebetulan berada di gunung Muria desa Colo) yang berada di bawah naungan LP Ma’arif NU Cabang Kudus. Untuk menindak lanjuti hasil musyawarah di tahun 2004 maka pada tahun 2005 KH. Abdul Haris mengumpulkan kembali para Kyai, akademisi dan tokoh masyarakat untuk membentuk struktur kepemimpinan.
Dengan diangkatnya kepemimpinan kepala sekolah yang baru yakni Bapak Muhammad Zaenul Anwar, S. Pd.I., MM. Dan KH. Abdul Haris selaku ketua pengurus, serta munculnya Ruhul Jihad untuk Izzatul Islam Walmuslimin dari segenap Stakeholder, maka pada Tahun 2008 dimulailah perintisan pembangunan gedung MA NU Raden Umar Sa’id Colo melalui proses awal pembelian sebidang tanah seluas 8800 m2 yang tepat berada di bawah gedung TPQ AT-Taqwa Colo dengan sumber pembiayaan dari swadaya masyarakat dan para aghniya’ desa Colo dan sekitarnya.
MA NU Raden Umar Sa’id terletak diantara 110036’ - 110050’ BT (Bujur Timur) dan 6051 - 7016’ LS (Lintang Selatan) pada ketinggian rata-rata 900 m di atas permukaan air laut dengan iklim tropis dengan temperature sedang 230 - 280 C serta curah hujan ±2.060 mm/Tahun tepat berada di bawah kaki Gunung Muria yang memiliki batas-batas wilayah sebagai berikut :
-       Sebelah Timur         : Berbatasan dengan desa Japan
-       Sebelah Selatan      : Berbatasan dengan desa Kajar
-       Sebelah Barat         : Pegunungan Muria
-       Sebelah Utara         : Pegunungan Muria

Lokasi MA NU Raden Umar Sa’id secara demografis berada di desa Colo Kecamatan Dawe Kabupaten Kudus tepatnya berada di kawasan wisata Religi Kanjeng Sunan Muria Raden Umar Sa’id yang merupakan salah satu Wali 9 di tanah Jawa.